Mangekyou Sharingan adalah evolusi mata Sharingan yang muncul saat seorang Uchiha mengalami emosi ekstrem, seperti kehilangan orang terkasih. Mata ini memberikan kekuatan unik, tetapi penggunaan berlebihan dapat menyebabkan kebutaan.
Untuk mengatasi kebutaan, seorang Uchiha bisa mentransplantasikan Mangekyou Sharingan dari kerabat dekatnya. Proses ini menghasilkan Eternal Mangekyou Sharingan yang lebih kuat dan bebas dari efek rabun.
Sasuke Uchiha mendapatkan Eternal Mangekyou Sharingan setelah menerima mata kakaknya, Itachi. Madara Uchiha juga membangkitkan mata ini dengan mengambil mata adiknya, Izuna.
Mangekyou Sharingan sendiri sudah langka, dan Eternal Mangekyou Sharingan bahkan lebih jarang dimiliki oleh anggota klan Uchiha. Sejauh ini, hanya Madara dan Sasuke yang dikonfirmasi memilikinya.
Eternal Mangekyou Sharingan memberi penggunanya kekuatan tanpa batasan penglihatan, menjadikan mereka salah satu ninja terkuat di dunia Naruto.